เรื่องย่อ... ขณะที่พวกโคนันกำลังชมวิวบนตึกเบลทรีทาวเวอร์ จู่ๆ มีกระสุนไรเฟิลไม่ทราบทิศทางพุ่งทะลุกระจกผ่านร่างชายคนหนึ่งตายลงไปต่อหน้าต่อตา โคนันได้แอบตามสืบร่วมกับเซระ มาสึมิ นักเรียนสาว ม.ปลาย ..คดีซุ่มยิงนี้เป็นคดีอาชญกรรมที่น่าพิศวง เป็นคดีไม่เคยเกิดขึ้นมาก่อนในญี่ปุ่น ทำให้ ตำรวจญี่ปุ่นกับ FBI จึงร่วมมือกันและตั้งเป็น “หน่วยสืบสวนคดีอาชญากรรมเฉพาะกิจขึ้น”